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将数据导入到Cytoscape 3.6.1软件

时间: 2025-08-11 20:19:33 来源: bitpath.chieffocus.com 作者: 教育创新

将化合物、五原则靶点、基于结合胶囊信号通路的蛛网中的质量相互作用整理到Excel表格中，将数据导入到Cytoscape 3.6.1软件，模型用Network Analyzer插件构建并分析舒筋活血胶囊“化合物-靶点-信号通路”的辨析标志网络药理图。其中化合物、舒筋靶蛋白和作用通路用节点表示，活血两节点间的五原则交互关系为边，有效性赋值的基于结合胶囊公式如下，具体数值见表4。蛛网中的质量

E=20%×e0+80%×(e1+e2+e3+e4)(1)

公式中，模型E——有效性赋值；

e0——化合物对应的辨析标志关键靶点数；

e1——靶点免疫调控路径数；

e2——靶点调节炎症反应路径数;

e1——靶点调节代谢过程路径数；

e1——靶点调节细胞增殖路径数

2.6基于蛛网模式构建多维特征网络

采用蛛网模式结合质量标志物筛选的五原则构建五维特征网络，通过计算回归面积来进行综合评价。舒筋

构建数学模型，活血公式如下：

式中，五原则S——候选化合物的回归面积；

α——相邻两个维度之间的夹角；

P——候选化合物不同维度的得分。

舒筋活血胶囊中各味药材含有的主要化合物28个，由于原药材和复方制剂中的化学成分不同，基于化合物的传递与溯源原则，赋予可传递到制剂中的个成分数值Pi（制剂中成分）=30、Pii（非制剂中成分）=10；在配伍原则上，根据生药在复方中君臣佐使的配伍原则，赋予40个成分数值Pi（君）=30、Pii（臣）=20、Piii（佐使）=10；在特有性原则中，九个药材中的特有性成分有18个，赋予18个特有性成分数值Pi=30、非特有性成分赋值Pi=10；在有效性原则中，基于网络药理学研究方法，舒筋活血胶囊治疗骨质疏松症筛选出16个有效性成分，按照1.7（1）式计算将16个化学成分赋值，具体数值如表3所示；在可测性原则中，中国药典中九味药材中的定量成分6个赋予数值Pi=30，有文献报道其含量测定方法的化学成分赋值Pi=10；无文献报道其含量测定方法的化合物赋值Pi=0。

将数值带入到“1.8”的数学模型中，结果见表5。通过计算总分绘制“蛛网模式图”如图4所示，计算28个成分的回归面积见图5，由图可知，排名前7的成分有羟基红花黄色素A、络石苷、刺五加苷B、α-香附酮、原儿茶酸、原儿茶醛和4-甲氧基水杨醛，其中4-甲氧基水杨醛为目前舒筋活血胶囊现行标准中的指标成分。

表5续

3结论

本文基于质量标志物筛选的五原则即传递与溯源、特有性、复方配伍、有效性和可测性，赋予舒筋活血胶囊中各化学成分的综合得分，绘制“蛛网模式”图，最终筛选出君药红花中的羟基红花黄色素A、臣药络石藤中的络石苷、君药槲寄生中的刺五加苷B、君药香附中的α-香附酮、君药狗脊中的原儿茶酸和原儿茶醛以及臣药香加皮中的4-甲氧基水杨醛这7个化合物为舒筋活血胶囊的关键质量标志物，可作为舒筋活血胶囊的质控指标。该方法为中药复方的指标成分选择提供参考依据，同时也为中药复方提供了一种新的质量控制模式。

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相关链接：质量标志物，化合物，原儿茶酸

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